Le master Génie des Procédés et Bioprocédés a pour objectif de former des professionnels dans le domaine du génie des procédés, exerçant un premier métier en industrie (production, ingénierie, études et recherche, développement industriel…) ou préparant un doctorat. Il permet d’acquérir des compétences transverses et une approche systémique aujourd’hui indispensables pour résoudre les problématiques pluridisciplinaires posées aux jeunes professionnels Les outils de base du génie des procédés sont enseignés en première année puis complétés dans un tronc commun au niveau de la seconde année. La seconde année vise l’application de ces outils à deux grands domaines : celui de la production d’énergie, intimement mêlé aux enjeux environnementaux, et celui des biotechnologies très présentes dans la production des aliments. Ainsi, deux parcours se distinguent au niveau de la deuxième année : un parcours « Procédés, Energie, Environnement » et un parcours « Procédés, Biotechnologies, Aliments ».

Le M2 Procédés, Energie, Environnement vient compléter des compétences génériques en génie des procédés (simulation, contrôle commande, transferts, réacteurs polyphasés, analyse et mesure). D’autre part, il donne  une ouverture vers des notions et connaissances indispensables à tout professionnel du domaine du Génie des procédés (bilans carbone, gestion des risques, efficacité énergétique). Ce socle d’enseignements, à la fois scientifiques et méthodologiques, est mutualisé avec le parcours « Procédés, Biotechnologies, Aliments ». Le parcours "Procédés, Energie, Environnement" complète ce socle commun par des enseignements dédiés  aux techniques de production d’énergie et aux matériaux associés. Il tire son originalité en mettant en avant les questions environnementales qui, tout à la fois, guident le choix et la mise œuvré des procédés (aspects de réglementation) et sont le terrain d’application et de développement de procédés novateurs (dépollution des sols, traitement de l’eau,…).